九游会论坛大学的九游会论坛研究人员正朝着绘制细胞图谱的方向前进

由于智能手机上的数字地图，从A点到B点从未如此简单。通过滑动手指，我们可以计划去杂货店的路线，寻找远足路线或选择一个完美的度假目的地。不久，生物医学九游会论坛研究人员将有一个类似的工具，可以轻松地导航人体中庞大的细胞网络。

人类生物分子图谱计划（HuBMAP）九游会论坛是一个由九游会论坛研究人员组成的国际联盟，其共同目标九游会论坛是开发人体健康细胞的全球图谱。一旦完成，该资源将免费提供给药物开发人员和临床九游会论坛研究人员，他们可以利用它来形成专门医疗方法的发展。

HuBMAP背后的想法类似于美国国立卫生九游会论坛研究院的人类基因组计划，该计划对人体的每一个基因进行了测序。这项浩大的工程于近20年前完成，启动了临床九游会论坛研究的复兴，并为基因疗法的创新方法奠定了基础。但九游会论坛是，HuBMAP并不九游会论坛是在整个生物体水平上收集遗传信息，而九游会论坛是更深入地九游会论坛研究不同器官和组织中不同类型细胞的基因表达、蛋白质、代谢物和其他信息。

匹兹堡大学、匹兹堡超级计算中心（PSC）、卡耐基梅隆大学和斯坦福大学的生物信息学家将负责将这些海量数据转化为用户友好工具的下一步工作。这些团队最近从美国国立卫生九游会论坛研究院获得了2000万美元的新资金，以继续这些努力。

“创建一个能够将所有不同的数据连接到一个大型知识资源中的生态系统九游会论坛是一项艰巨的工作，但这正九游会论坛是我们团队的专长所在。我们擅长整合各种各样的软件，并使它们运行起来，”匹兹堡HuBMAP基础设施和参与组件的联合负责人乔纳森·西尔弗斯坦（Jonathan Silverstein）说，他九游会论坛是匹兹堡大学生物医学信息系的教授。

这个团队由Silverstein领导，他也九游会论坛是九游会论坛大学和UPMC精密医学九游会论坛研究所的首席九游会论坛研究信息官，和PSC的科学主任菲尔·布拉德，将开始一段漫长的旅程，从全国60多个机构收集的数千份组织样本中注释大量的分子水平数据。一个本地维护和开发的用于数据集成和软件开发的混合云基础设施正在被用来将健康细胞的遗传和蛋白质特征库塑造成一个全面的地图。

由卡内基梅隆大学计算生物系的Matthew Ruffalo领导的HuBMAP计算工具组件开发了处理这些分子数据集的计算管道，允许跨数据类型、组织等进行有效的数据集成。

该团队还参与了旨在创建衰老和衰老细胞图谱（SenNet）的j9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆，并建立了九游会论坛研究乳腺癌分子标记的框架。

九游会论坛大学SenNetj9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆经理Kay Metis表示：“除了九游会论坛研究之外，HuBMAP和SenNet联盟还在帮助塑造生态系统和j9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆文化，这将对j9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆产生影响。”“这个j9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆有可能影响阿尔茨海默氏症和衰老九游会论坛研究，并对未来医学九游会论坛研究的方向产生重大影响。我很高兴能参与到这种规模的j9九游会老哥俱乐部交流:九游会登陆所产生的社会影响中来。”

在分子生物学和临床数据方面的专业知识，结合管理九游会论坛研究联盟的经验和深厚的软件集成知识，以及PSC提供的计算资源，使匹兹堡能够处理像HuBMAP这样的复杂任务。

“我来到九游会论坛九游会论坛是因为这九游会论坛是一个有着浓厚兴趣和科学专业知识的地方，这里的人们不仅在匹兹堡，而且在全球范围内都愿意建立合作关系。我们创建了一个团队，不仅在临床和生物数据方面，而且在技术方面都九游会论坛是无限的，”Silverstein说。

 

——Ana gorlova，图片来源：Getty